Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesini 2003 yılında bitirdi. Yüksek Lisansını Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Kelâm Anabilim Dalında M. Saim Yeprem danışmanlığında “Reenkarnasyonla İlişkilendirilen Ayetlerin Değerlendirilmesi” isimli teziyle tamamladı (2005). Bir süre Milli Eğitim Bakanlığında Din Kültürü ve Ahlak Bilgisi dersi öğretmenliği yaptıktan sonra 2012 yılında Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Kelam Anabilim Dalına öğretim görevlisi olarak atandı. Aynı yıl İlyas Çelebi danışmanlığında “Klasik Dönem Kelâm Atomculuğunun Günümüz Kozmolojisi Açısından Değerlendirilmesi” isimli tezini savunarak Doktor ünvanını aldı. İlk post doktora araştırmasını TÜBİTAK Yurt Dışı Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı kapsamında Kanada, McGill Üniversitesi Institute of Islamic Studies’de “Criticisims of Atomism in Classical Islamic Thought” (Klasik İslam Düşüncesinde Atomculuk Eleştirisi) isimli çalışmasıyla gerçekleştirdi (2014). İkinci post doktora araştırmasını ise Amerika Birleşik Devletleri’ndeki Syracuse Üniversitesinde “The Kalam Cosmological Arguments and Kant’s Antinomies of Reason: A Critical Assessment” (Kelam Kozmolojik Argümanları ve Kant’ın Akıl Çatışmaları: Eleştirel Bir Değerlendirme) adlı çalışmasıyla yaptı (2019). 2017 yılında doçent oldu. Halihazırda Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Temel İslam Bilimleri Kelam Anabilim Dalında profesör olarak görevine devam etmektedir.
Kitaplar:
- Klasik İslâm Düşüncesinde Atomculuk Eleştirileri; Pasifik, 2016
- Kelam Atomculuğu ve Modern Kozmoloji; TDV, 2018
- Kelam İlmi ve İslam Hukukunda İçerik Sorunları; Ensar Neşriyat, 2019 (İlyas Çelebi ile birlikte)
- Kelam Fizik Kuramı; Klasik, 2020 (Alnoor Dhanani’den çeviri)
- Güncel Kelam Tartışmaları; M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2020 (Enis Doko ile birlikte)
- Güncel Kelam Tartışmaları 2; M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2021 (Enis Doko ile birlikte)
- Din ve Bilim Açısından Yaratılış; M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2022
- Tarihten Günümüze Tartışmalı İnanç Meseleleri 1, M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2016
- Tarihten Günümüze Tartışmalı İnanç Meseleleri 2; M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2018 (İsmail Taşpınar ile birlikte)
- Kelamın Kozmolojik Argümanı & Yeni Bir Değerlendirme; Albaraka Yayınları, 2022 (Jacobus Erasmus’tan çeviri)
- Din ve Bilim Açısından Yaratılış, M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2023 (Enis Doko ile birlikte)
- Kelamın Nesne Kuramı & Cüveynî’de Cisim, Hareket ve Nedensellik, M. Ü. İlahiyat Fakültesi Vakfı Yayınları, 2024
- Yapay Zeka ve İslam (ed.), Timaş Akademi, 2025
Mehmet Bulgen’in Geleceğin Akademisyenlerini Arıyoruz Projesindeki Programları:
- 2022-2023 eğitim yılı bahar dönemi; “Kelam İlminde Yöntem”