2000 yılında Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesinden mezun oldu. 2002 yılında Prof. Dr. Bekir Karlığa’nın danışmanlığında yazdığı “İbn Sînâ Felsefesinde Âlemin Mükemmelliği Düşüncesi” başlıklı teziyle Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Anabilim Dalında yüksek lisansını tamamladı. 2005-2006 yıllarında Yale Üniversitesi (ABD) Yakın Doğu Dilleri ve Medeniyetleri Bölümünde araştırmacı olarak çalışmalarını sürdürdü. 2008 yılında İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Anabilim Dalında Doç. Dr. Ömer Mahir Alper’in danışmanlığında tamamladığı “İslam Felsefesinde Metafizik Bir Problem Olarak İmkân” başlıklı tezle doktor unvanı aldı. 2009’dan bu yana İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Felsefe Bölümü Türk-İslam Düşünce Tarihi Anabilim Dalında öğretim üyesi olarak görev yapmakta olan Kaya, 2012 yılında Felsefe alanında doçent unvanını aldı. 2018’de profesör olan Cüneyt Kaya, 2016- 2019 yılları arasında aynı fakülteye bağlı İslam Araştırmaları Merkezi müdürü olarak görev yapmıştır.
Kitaplar:
- Bir ve Çok: Âmirî Felsefesinde Tanrı ve Âlem, Klasik Yayınları, 2017
- Varlık ve İmkân: Aristoteles’ten İbn Sînâ’ya İmkânın Tarihi, Klasik Yayınları, 2011
- Babanzâde Ahmet Naim: Hayatı-Eserleri-Fikirleri, Zeytinburnu Belediyesi Kültür Yayınları, 2018 (İsmail Kara ile birlikte)
Editörlük & Derleme:
- Türkiye’de/Türkçede Felsefe Üzerine Konuşmalar, Küre Yayınları, 2009
- Gazzâlî Konuşmaları, Küre Yayınları, 2012
- İslam Düşüncesinde Süreklilik ve Değişim & Seyyid Şerif Cürcânî Örneği, (editör) Klasik Yayınları, 2015
- Babanzâde Ahmed Naim, (Cahid Şenel ile birlikte) Felsefe Dersleri, Klasik Yayınları, 2017
- Babanzâde Ahmed Naim, (Cahid Şenel ile birlikte) Felsefe Makaleleri, Klasik Yayınları, 2017
- İslam Felsefesi & Tarih ve Problemler, İSAM Yayınları, 2017
- Mukaddime & Osmanlı Tercümesi, (Halit Özkan, Sami Erdem, Yavuz Yıldırım ile birlikte) Klasik Yayınları, 2009
- İslam ve Klasik (Sami Erdem ile birlikte), Klasik Yayınları, 2008
- İslam Felsefesinin Ana Konular 3.Cilt (Rahim Acar ile birlikte), Küre Yayınları, 2023
Çeviriler:
- Dimitri Gutas, İbn Sina’nın Mirası, Klasik Yayınları, 2024
- Adam Gacek, Arapça Elyazmaları İçin Rehber, Klasik Yayınları, 2017 (Ali Benli ile birlikte)
- Peter Adamson-Richard C. Taylor, İslam Felsefesine Giriş, Küre Yayınları, 2007
- Ahmet Davutoğlu, Alternatif Paradigmalar & İslam ve Batı Dünya Görüşlerinin Siyaset Teorisine Etkisi, Küre Yayınları, 2018
- Gazzâlî, Halkı Kelam İlminden Geri Tutma, Klasik Yayınları, 2022 (Mahmut Kaya ile birlikte)
- Gazzâlî, Delaletten Kurtuluş & El-Munkız Mine’d-Dalal Ve’l-Mufsıh Bi’l-Ahval, Klasik Yayınları, 2022 (Mahmut Kaya ile birlikte)
- Gazzâlî, Kelâm ve Halk & İlcâmu’l-avâm an ilmi’l-kelâm- el-Kânûnu’lküllî fi’t-te’vîl, Klasik Yayınları, 2018 (Mahmut Kaya ile birlikte)
M. Cüneyt Kaya’nın Geleceğin Akademisyenlerini Arıyoruz Projesindeki Programları:
- 2023-2024 eğitim yılı; “İslam Felsefesinin Klasiklerini Okuma Yöntemi”